生物实验室必备的10款APP!

 
点击 33回复 0 原帖 2023-10-29 10:29 IP属地 江苏南京

如今,智能手机和平板电脑正在改变我们的生活,也在改变我们的实验室。打开手机,我们随时随地可以查找文献,阅读说明书。通过手机,我们也能远程监控仪器的运行状态。甚至在搭地铁的时候,我们也能订购试剂。

  的确,现在有许许多多的科学应用程序(app),适用于iOS和Android设备,覆盖实验的方方面面,从实验计划到定时器和计算器。然而,这些app的采用很慢。ZappyLab的共同创办人Lenny Teytelman表示:“这是一个服务不足的市场。”ZappyLab专门为科学家开发应用程序。

  Teytelman曾发表了一篇博文,题目为“亨利•福特是傻瓜吗?(科学家是否会在实验室中使用手机?”。他提到了一些抱怨,比如害怕污染个人设备,对移动应用程序不感兴趣以及戴着手套不方便操作。他认为,这些问题都是用来转移注意力的。这些app未能成功,不是因为没有兴趣,而是因为它们本身不吸引人。

  Teytelman解释道:“你必须确保app的质量很高,并建立知名度。如果你认为你做一个一般般的app,人们也会涌过来,那么你错了。你必须做一些真的很好的。”

  下面就是一些对当今的生物实验室十分有用的app。当然,这并非一份完整的名单。如果你另有钟爱的app,欢迎在下面留言。

  1. Bench Tools

  ZappyLab的Bench Tools集合包括四款实用的app:定时器、计数器、摩尔浓度计算器和生长曲线生成器,以及一款基于大众资源的实验方案库(Protocols)和文献管理和推荐工具(PubChase)。据Teytelman介绍,Protocols是拼图中的关键一块。ZappyLab的目标是建立科学方法的维基百科。“为此,我们要给人们一种简单的方法来创建和共享实验方案。”最终,他希望将app与供应商联系起来,这样用户就能在应用程序内购买试剂。

  2. Evernote

  这是一款非常流行的笔记应用程序,它为存储文章、涂鸦、音频等提供了一种很好的方式。Evernote适用于iOS、Android、Windows Phone和黑莓设备,并不是专门为科学家设计的,但却有着广泛的吸引力。它实际上是一个非结构化的可搜索数据库,能够存储你能想到的任何东西。例如,有些人利用Evernote存储食谱和葡萄酒标签。哈佛医学院的副教授John Rinn表示:“我最喜欢在与学生和博士后见面后拍下白板上的笔记。”

  3. Fluorescence SpectraViewer

  Life Technologies的Fluorescence SpectraViewer让iOS用户能够查看和比较荧光蛋白和染料。它作为SpectraViewer在线工具的移动版本,让研究人员能够对光谱进行作图和比较,检查多个荧光基团的兼容性,并将其结构发邮件给自己或其他人。

  4. JuiceSSH

  JuiceSSH是一个适用于Android设备的secure shell(SSH)客户端。利用SSH,研究人员能够通过手机或平板电脑打开一个远程的终端窗口,检查系统状态,启动和停止任务,并做任何想做的事情。加州大学戴维斯分校的博士生Russell Neches认为,JuiceSSH是到目前为止最好的SSH客户端。他经常利用它来监控大型的计算任务,如基因组组装和OTU聚类。

  5. Labalert

  对于那些需要定期监控冰箱和培养箱的研究人员而言,他们可以考虑一下松下(Panasonic)的Labalert系统。据松下保健公司北美地区的产品专家Carl Radosevich 介绍,Labalert是一个环境检测系统。此系统包含物理探头(如温度、湿度和二氧化碳),可放置在待监控的仪器内。这些与发射器相连接,后者又与一个类似路由器的“网关”通讯。通过Labalert iOS app的浏览器,用于可以确保他们的设备是否正常工作,设置权限,并分配维护任务等。据介绍,Labalert在疫苗和血液储存的监控上特别受欢迎。

  6. metaMobile

  Molecular Devices的metaMorph 软件让研究人员能够控制显微镜并自动化,metaMobile软件则将这种控制延伸到iPad和iPhone。据MD的产品经理Bruce Gonzaga介绍,此款app方便了多任务管理,让用户无需坐在显微镜前,也能追踪他们的实验。用户可实时查看图像,按下照相机的快门,设置和停止实验等。管理人员还可以利用它来远程监控多台仪器。

  7. Molecules

  如果你坐在实验台旁,想快速浏览一下你感兴趣的蛋白质的结构,那么Molecules适合你。这款app显示了蛋白质的三维结构,它们来自PubChem和蛋白质数据库(PDB)。用户可通过标准的手势来旋转和操作。

  8. PCalc

  没有一名研究人员能少得了计算器,而TLA Systems的PCalc是最好的。这款app的售价为9.99美元,包含多个功能,包括科学运算、转换、常量,甚至是用户定义的函数。你还可以选择自己喜欢的界面。Android用户可以看看RealCalc计算器。

  9. PubMed On Tap

  如果你需要从移动设备上访问PubMed,可以看看PubMed On Tap。有了这款app,你能在手机或平板电脑上搜索PubMed,并获取PDF。Android用户可以试试PubMed Mobile。

  10. 随你喜欢

  最后,你可以选择你喜爱的品牌所开发的app啦。比如,NEB的NEB Tools提供了寻找酶、双酶切和Tm计算器等功能。Sigma-Aldrich开发了多个app,包括摩尔浓度计算器,而AB SCIEX的MS iCalc提供了一系列与质谱相关的计算器。Promega甚至能利用手机的摄像头进行菌落计数。


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